O Dr. Bolivar Trask acredita que os mutantes são uma ameaça para a humanidade. Ele desenvolve gigantescos robôs chamados Sentinelas, que perseguem impiedosamente os mutantes. Os poucos sobreviventes precisam viver escondidos. Wolverine viaja no tempo para procurar os jovens Xavier e Magneto e impedir que eles sejam caçados e aniquilados no futuro.